Hledat:

Set-top-boxy Parfémy Krása Produkty pro zdraví Hodinky Elektro Šperky Nábytek Nářadí a zahrada Outdoor Počítače a notebooky
 

i, 09 Jan 2009 13:55:16 GMT Server: Apache X-Powered-By: PHP/5.2.4-2ubuntu5wm1 Cache-Control: private, s-maxage=0, max-age=0, must-revalidate Content-Language: cs Vary: Accept-Encoding,Cookie X-Vary-Options: Accept-Encoding;list-contains=gzip,Cookie;string-contains=cswikiToken;string-contains=cswikiLoggedOut;string-contains=cswiki_session;string-contains=centralauth_Token;string-contains=centralauth_Session;string-contains=centralauth_LoggedOut Last-Modified: Tue, 28 Oct 2008 21:16:31 GMT Content-Length: 26117 Content-Type: text/html; charset=utf-8 X-Cache: MISS from sq23.wikimedia.org X-Cache-Lookup: MISS from sq23.wikimedia.org:3128 X-Cache: MISS from knsq26.knams.wikimedia.org X-Cache-Lookup: MISS from knsq26.knams.wikimedia.org:3128 X-Cache: MISS from knsq3.knams.wikimedia.org X-Cache-Lookup: MISS from knsq3.knams.wikimedia.org:80 Via: 1.0 sq23.wikimedia.org:3128 (squid/2.6.STABLE21), 1.0 knsq26.knams.wikimedia.org:3128 (squid/2.6.STABLE21), 1.0 knsq3.knams.wikimedia.org:80 (squid/2.6.STABLE21) Connection: close Bakteriorodopsin - Wikipedie, otevřená encyklopedie

Bakteriorodopsin

Struktura bakteriorhodopsinu: 7 α-šroubovicových segmentů a kovalentně vázaná prostetická skupina retinal
Retinal tvoří s bílkovinovým skeletem bakteriorhodopsinu vázán podobně jako v rhodopsinu Schiffovu bázi (viz text)

Bakteriorhodopsin je integrální membránový protein obsažený ve slanomilných archeích Halobacteria. Při nízkém obsahu kyslíku tyto organismy v membráně vytváří okolo 0,5 µm[1] široké purpurové nebo nachové oblasti, jejichž jedinou bílkovinnou složkou je právě bakteriorhodopsin.

Obsah

[editovat] Struktura

Bakteriorhodopsin se skládá z 247 aminokyselin.[1] Obsažená prostetická skupina je kovalentně vázaný retinal, který patří mezi chromofory (světlo absorbující skupiny) a zodpovídá za purpurovou barvu bakteriorhodopsinu. Vazba mezi retinalem a Lysinem-216 je Schiffova báze -CH=N(+)H-, podobně se váže i v rodopsinu (oční pigment).

Bílkovinná část obsahuje 7 α-helikálních hydrofobních nepolárních struktur, které jsou okolo 25 aminokyselin dlouhé.[1] Jelikož jsou téměř dokonale kolmé k rovině membrány, dobře interagují s hydrofobním vnitřkem fosfolipidové dvouvrstvy a jsou velmi stabilizované. Vnitřní skupiny jsou více polární a tvoří hydrofilní kanál, který umožňuje pruchod vodíkovým kationtům. I jiné membránové pumpy a kanály mají podobné složení. N-koncová skupina (H3N+-) je umístěna vně buňky, šroubovice probíhají přes membránu střídavě dovnitř a ven, a proto je C-koncová skupina (-COO-) naopak uvnitř buňky.

[editovat] Význam

Hlavní funkcí bakteriorhodopsinu je fotofosforylace:

  1. Pomocí světelné energie pumpuje přes membránu vodíkové kationty a vytváří rozdíl elektrického potenciálu.
  2. Vzniklý gradient (koncentrační spád) protonů je využit k syntéze energeticky bohaté sloučeniny ATP z ADP a anorganického fosfátu (fosforečnanu).

Nedostatek kyslíku pro získání energine oxidací živin buněčným dýcháním je tak kompenzován energiií Slunce. Nejedná se však o fotosyntézu, neboť světelná energie se zde nevyužívá k syntéze sacharidů a podobných zásobních a stavebních sloučenin.

V klidovém stavu je Schiffova báze retinal-lysin protonovaná (RH+, nanázaný vodíkový kation) a celá struktura je otevřena dovnitř membrány. Po exitaci absorpcí světla nastane konformační změna, což způsobí otočení R*H+ směrem ven z membrány (R* je exitovaná forma R). Dále se zvýší disociační konstanta (snížení pK) a dojde k uvolnění protonu vně membrány. Pumpa se posléze vrací do klidového stavu a R znovu směřuje dovnitř membrány. Relaxace způsobí pokles disociační konstanty (vrůst pK) a dojde k navázání nového protonu z vnitřní strany membrány (RH+). Pumpa se opět nachází ve výchozím stavu a výsledkem jednoho cyklu je přenos jednoho protonu z vnitřní na vnější stranu membrány. Na syntézu jedné molekuly ATP je potřeba přenést 2-3 protony.[2]

[editovat] Zdroje

[editovat] Reference

  1. a b c VOET, D.; VOETOVÁ, J. Biochemie. 1. čes. vyd. Praha : Victoria Publishing, 1995. ISBN 80-85605-44-9. S. 313–314.
  2. VOET, D.; VOETOVÁ, J. Biochemie. 1. čes. vyd. Praha : Victoria Publishing, 1995. ISBN 80-85605-44-9. S. 615–616.
 
i, 09 Jan 2009 13:55:16 GMT Server: Apache X-Powered-By: PHP/5.2.4-2ubuntu5wm1 Cache-Control: private, s-maxage=0, max-age=0, must-revalidate Content-Language: cs Vary: Accept-Encoding,Cookie X-Vary-Options: Accept-Encoding;list-contains=gzip,Cookie;string-contains=cswikiToken;string-contains=cswikiLoggedOut;string-contains=cswiki_session;string-contains=centralauth_Token;string-contains=centralauth_Session;string-contains=centralauth_LoggedOut Last-Modified: Tue, 28 Oct 2008 21:16:31 GMT Content-Length: 26117 Content-Type: text/html; charset=utf-8 X-Cache: MISS from sq23.wikimedia.org X-Cache-Lookup: MISS from sq23.wikimedia.org:3128 X-Cache: MISS from knsq26.knams.wikimedia.org X-Cache-Lookup: MISS from knsq26.knams.wikimedia.org:3128 X-Cache: MISS from knsq3.knams.wikimedia.org X-Cache-Lookup: MISS from knsq3.knams.wikimedia.org:80 Via: 1.0 sq23.wikimedia.org:3128 (squid/2.6.STABLE21), 1.0 knsq26.knams.wikimedia.org:3128 (squid/2.6.STABLE21), 1.0 knsq3.knams.wikimedia.org:80 (squid/2.6.STABLE21) Connection: close Bakteriorodopsin - Wikipedie, otevřená encyklopedie

Bakteriorodopsin v jiných jazycích: Dansk, Deutsch, English, Español, Français, Magyar, 日本語, Українська

Tento článek je převzat z české wikipedie - otevřené encyklopedie, originální článek naleznete na adrese: „http://cs.wikipedia.org/wiki/Bakteriorodopsin
Stránka byla naposledy upravena v Stránka byla naposledy editována 28. 10. 2008 v 21:16.
Veškerý text je dostupný za podmínek GNU Free Documentation License (Autorské právo pro podrobnosti).