Bioinformatika

Mapa lidského chromozomu X (z webu NCBI). Bioinformatika přispěla značnou měrou k tomuto zmapování.

Bioinformatika je vědní disciplína, která se zabývá metodami pro shromážďování, analýzu a vizualizaci rozsáhlých souborů biologických dat, zejména dat molekulárně-biologických.

Předmětem zájmu a používanými metodami se bioinformatika prolíná s dalšími příbuznými obory, např. molekulární biologií, genomikou, proteomikou, genetikou, výpočetní biologií, matematickou biologií, systémovou biologií, teoretickou biologií, biomedicínskou informatikou, biomedicínským inženýrstvím, výpočetní chemií, informatikou a počítačovou lingvistikou.

[editovat] Typická data

• Sekvence proteinů a nukleových kyselin (DNA, RNA)
• Struktura makromolekul (hlavně proteinů)
• Údaje o aktivitě a expresi genů
• Údaje o funkcích genů a jejich produktů
• Údaje o interakcích mezi proteiny a DNA

[editovat] Práce bioinformatika

• in silico, tj. práce či simulace na počítači, na rozdíl od práce na živých organismech v přirozených (in vivo) či laboratorních (in vitro) podmínkách
• práce s velkými objemy dat
• vyhledávání subsekvencí v datech
• srovnávání podobných sekvencí, analýza sekvencí
• snaha předpovídat strukturu a funkci proteinů
• výsledky analýz zobrazovat graficky
• dynamické modelování
• užitečná pro biology, lékaře, právníky, policisty, konzumenty GMO

[editovat] Centrální dogma

Podrobnější informace naleznete v článku Centrální dogma molekulární biologie.

• DNA -> RNA -> protein
• protein (gen) -> struktura -> funkce ?
• problém spočívá v odhalení kódujícího genu podle proteinu a podle genu určit funkci proteinu

[editovat] Vědecké časopisy

• Applied Bioinformatics
• Bioinformatics
• BMC Bioinformatics
• Briefings in Bioinformatics
• In Silico Biology
• Journal of Bioinformatics, Biology and Computational Biology

[editovat] Vědecké a zájmové společnosti

• ISCB(International Society for Computational Biology)
• FOBIA (sekce ČSBMB)

[editovat] Paranormální jevy

Pojem bioinformatika lze najít i literatuře zabývající se paranormálními jevy, kde je tímto termínem myšleno mimosmyslové vnímání^[1].

[editovat] Literatura

• Fatima Cvrčková, Úvod do praktické bioinformatiky, Academia, ISBN 80-200-1360-1, 2006 (1. vydání)
• Dan E. Krane, Fundamental concepts of Bioinformatics, Benjamin Cummings, ISBN 0805346333
• Jean-Michel Claverie, Bioinformatics for dummies, SBN 0764516965

[editovat] Reference

1. ↑ Přehlížené přiznání na esoterické encyklopedii

[editovat] Související články

Tento biochemický článek je příliš stručný nebo neobsahuje důležité informace. Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte.